常见的并发症包括续发细菌性肺炎，浓痰堵住气管引起肺部扩张不全(atelectasis)，因过分用力咳嗽引起流鼻血、结膜下出血、下眼睑水肿、甚至脑出血、长期咳嗽、呕吐、无法进食引起营养不良、抽搐及脑症(encephalopathy)、气胸、皮下气肿、呼吸暂停等。以细菌性肺炎或成人呼吸窘迫症候群(adultrespiratorydistresssymdrome)是造成各年龄层死亡常见的原因。
一般百日咳患者之预後是跟患者之年龄层有关，在年纪较大的大小孩及成人得到百日咳，其预後很好，但在婴儿特别是小於6个月的婴儿有很高的死亡率(0.3~1.3%)及有脑症之比率(0.5~1.4%)，郴州三代助孕此外在长期追踪的结果发现，若有呼吸暂停及抽畜之病患与其後续智力发展有缺陷有关。
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